Ninja hiện vẫn còn tồn tại nhưng có rất ít thông tin về họ - những chiến binh âm thầm viết nên một phần trang sử thời phong kiến ở Nhật Bản.
Hoạt động chủ yếu từ thế kỷ 15 đến thế kỷ 17, thời điểm bất ổn chính trị nhất trong lịch sử Nhật Bản, Ninja (hay Shinobi) là danh xưng chỉ những cá nhân hay tổ chức đánh thuê chuyên hoạt động bí mật. Theo ghi chép, Ninja là những người sử dụng Nhẫn thuật - Ninjutsu - loại hình chiến đấu biệt lập phát triển chủ yếu từ vùng Iga tại tỉnh Mie và làng Koka tại tỉnh Shiga. Khi Nhật Bản thống nhất năm 1603, vai trò của các phái Ninja cũng phai nhạt dần. Ngày nay, Ninja thường mặc những trang phục rất hiện đại, họ được thuê làm gián điệp, vệ sĩ hoặc ám sát thuê. Cấp cao nhất của Ninja là Jonin rồi đến Chunin và cuối cùng là Genin.